Firefly and PC GAMESS-related discussion club


 
Learn how to ask questions correctly  
 
 
We are NATO-free zone
 



Problem with getting the SCF to converge

sepehr
stahmase@sfu.ca


Dear all,
I got the optimization running for my monomer, however it does not converge. Even after 200 steps it sais that SCF failed to converge, update the geometry and run again. Any suggestion on how to get it to converge?

In the output there are warnings saying that there's partial linear dependency, could the Cartesian coordinates be the reason and I should change to spherical?

As the output file is large I only included the start (input) and the last step of the output file here ...


I appreciate any help and idea,
Thanks
Sepehr

running: mpiexec  --rankfile /data2/PBStmp/5868103.jasper-usradm.westgrid.ca/PBI_success_scf.rankfile2.txt -np 24 --mca rmaps_rank_file_path /data2/PBStmp/5868103.jasper-usradm.westgrid.ca/PBI_success_scf.rankfile2.txt -report-bindings  -stdin none /global/software/gamess/gamess-20130501/gamess.00.x
         ******************************************************
         *         GAMESS VERSION =  1 MAY 2013 (R1)          *
         *             FROM IOWA STATE UNIVERSITY             *
         * M.W.SCHMIDT, K.K.BALDRIDGE, J.A.BOATZ, S.T.ELBERT, *
         *   M.S.GORDON, J.H.JENSEN, S.KOSEKI, N.MATSUNAGA,   *
         *          K.A.NGUYEN, S.J.SU, T.L.WINDUS,           *
         *       TOGETHER WITH M.DUPUIS, J.A.MONTGOMERY       *
         *         J.COMPUT.CHEM.  14, 1347-1363(1993)        *
         **************** 64 BIT INTEL VERSION ****************

SINCE 1993, STUDENTS AND POSTDOCS WORKING AT IOWA STATE UNIVERSITY
 AND ALSO IN THEIR VARIOUS JOBS AFTER LEAVING ISU HAVE MADE IMPORTANT
 CONTRIBUTIONS TO THE CODE:
    IVANA ADAMOVIC, CHRISTINE AIKENS, YURI ALEXEEV, POOJA ARORA,
    ANDREY ASADCHEV, ROB BELL, PRADIPTA BANDYOPADHYAY, JONATHAN BENTZ,
    BRETT BODE, GALINA CHABAN, WEI CHEN, CHEOL HO CHOI, PAUL DAY,
    ALBERT DEFUSCO, TIM DUDLEY, DMITRI FEDOROV, GRAHAM FLETCHER,
    MARK FREITAG, KURT GLAESEMANN, DAN KEMP, GRANT MERRILL,
    NORIYUKI MINEZAWA, JONATHAN MULLIN, TAKESHI NAGATA,
    SEAN NEDD, HEATHER NETZLOFF, BOSILJKA NJEGIC, RYAN OLSON, MIKE PAK,
    JIM SHOEMAKER, LYUDMILA SLIPCHENKO, SAROM SOK, JIE SONG,
    TETSUYA TAKETSUGU, SIMON WEBB, SOOHAENG YOO, FEDERICO ZAHARIEV

ADDITIONAL CODE HAS BEEN PROVIDED BY COLLABORATORS IN OTHER GROUPS:
    IOWA STATE UNIVERSITY:
         JOE IVANIC, LAIMUTIS BYTAUTAS, KLAUS RUEDENBERG
    UNIVERSITY OF TOKYO: KIMIHIKO HIRAO, TAKAHITO NAKAJIMA,
         TAKAO TSUNEDA, MUNEAKI KAMIYA, SUSUMU YANAGISAWA,
         KIYOSHI YAGI, MAHITO CHIBA, SEIKEN TOKURA, NAOAKI KAWAKAMI
    UNIVERSITY OF AARHUS: FRANK JENSEN
    UNIVERSITY OF IOWA: VISVALDAS KAIRYS, HUI LI
    NATIONAL INST. OF STANDARDS AND TECHNOLOGY: WALT STEVENS, DAVID GARMER
    UNIVERSITY OF PISA: BENEDETTA MENNUCCI, JACOPO TOMASI
    UNIVERSITY OF MEMPHIS: HENRY KURTZ, PRAKASHAN KORAMBATH
    UNIVERSITY OF ALBERTA: TOBY ZENG, MARIUSZ KLOBUKOWSKI
    UNIVERSITY OF NEW ENGLAND: MARK SPACKMAN
    MIE UNIVERSITY: HIROAKI UMEDA
    MICHIGAN STATE UNIVERSITY:
         KAROL KOWALSKI, MARTA WLOCH, JEFFREY GOUR, JESSE LUTZ,
         WEI LI, PIOTR PIECUCH
    UNIVERSITY OF SILESIA: MONIKA MUSIAL, STANISLAW KUCHARSKI
    FACULTES UNIVERSITAIRES NOTRE-DAME DE LA PAIX:
         OLIVIER QUINET, BENOIT CHAMPAGNE
    UNIVERSITY OF CALIFORNIA - SANTA BARBARA: BERNARD KIRTMAN
    INSTITUTE FOR MOLECULAR SCIENCE:
         KAZUYA ISHIMURA, MICHIO KATOUDA, AND SHIGERU NAGASE
    UNIVERSITY OF NOTRE DAME: DAN CHIPMAN
    KYUSHU UNIVERSITY:
         HARUYUKI NAKANO,
         FENG LONG GU, JACEK KORCHOWIEC, MARCIN MAKOWSKI, AND YURIKO AOKI,
         HIROTOSHI MORI AND EISAKU MIYOSHI
    PENNSYLVANIA STATE UNIVERSITY:
         TZVETELIN IORDANOV, CHET SWALINA, JONATHAN SKONE,
         SHARON HAMMES-SCHIFFER
    WASEDA UNIVERSITY:
         MASATO KOBAYASHI, TOMOKO AKAMA, TSUGUKI TOUMA,
         TAKESHI YOSHIKAWA, YASUHIRO IKABATA, HIROMI NAKAI
    NANJING UNIVERSITY: SHUHUA LI
    UNIVERSITY OF NEBRASKA:
         PEIFENG SU, DEJUN SI, NANDUN THELLAMUREGE, YALI WANG, HUI LI
    UNIVERSITY OF ZURICH:
         ROBERTO PEVERATI, KIM BALDRIDGE
    N. COPERNICUS UNIVERSITY AND JACKSON STATE UNIVERSITY:
         MARIA BARYSZ


PARALLEL VERSION RUNNING ON    12 PROCESSORS IN    12 NODES.

EXECUTION OF GAMESS BEGUN Fri Feb  6 03:11:14 2015

          ECHO OF THE FIRST FEW INPUT CARDS -
INPUT CARD>!   File created by the GAMESS Input Deck Generator Plugin for Avogadro        
INPUT CARD> $CONTRL SCFTYP=ROHF RUNTYP=OPTIMIZE DFTTYP=B3LYP MULT=1 $END                  
INPUT CARD> $CONTRL ICHARG=0 $END                                                          
INPUT CARD> $SYSTEM MWORDS=64 TIMLIM=6000 $END                                            
INPUT CARD> $BASIS GBASIS=N31 NGAUSS=6 NDFUNC=2 NPFUNC=1 DIFFSP=.TRUE. $END                
INPUT CARD> $STATPT NSTEP=100 OPTTOL=1.0D-5 $END                                          
INPUT CARD> $SCF DIRSCF=.T. FDIFF=.FALSE. DIIS=.T. SOSCF=.F. $END                          
INPUT CARD>                                                                                
INPUT CARD> $DATA                                                                          
INPUT CARD>PBI_success_test                                                                
INPUT CARD>C1                                                                              
INPUT CARD>H     1.0    17.63324   -16.23610     0.40502                                  
INPUT CARD>C     6.0    20.21260   -16.42902     2.07308                                  
INPUT CARD>C     6.0    21.57603   -16.72569     1.92875                                  
INPUT CARD>C     6.0    22.43688   -15.71712     1.48006                                  
INPUT CARD>C     6.0    21.91949   -14.46399     1.18812                                  
INPUT CARD>C     6.0    20.56699   -14.13845     1.33137                                  
INPUT CARD>C     6.0    19.69863   -15.15114     1.78585                                  
INPUT CARD>H     1.0    21.96397   -17.71139     2.15943                                  
INPUT CARD>H     1.0    20.19640   -13.14675     1.09162                                  
INPUT CARD>C     6.0    24.12423   -14.54855     0.82501                                  
INPUT CARD>C     6.0    27.01404   -12.64995    -0.72556                                  
INPUT CARD>C     6.0    25.70852   -13.04196    -0.41210                                  
INPUT CARD>C     6.0    25.47573   -14.10604     0.47150                                  
INPUT CARD>C     6.0    26.58017   -14.77302     1.02179                                  
INPUT CARD>C     6.0    27.88394   -14.37871     0.71258                                  
INPUT CARD>C     6.0    28.09992   -13.31572    -0.16046                                  
INPUT CARD>H     1.0    27.18395   -11.82983    -1.41871                                  
INPUT CARD>H     1.0    28.72682   -14.90648     1.15118                                  
INPUT CARD>C     6.0    17.30906   -15.53183     1.16983                                  
INPUT CARD>C     6.0    15.93354   -15.30324     1.32795                                  
INPUT CARD>C     6.0    15.51217   -14.39922     2.31083                                  
INPUT CARD>C     6.0    16.46426   -13.75431     3.09168                                  
INPUT CARD>C     6.0    17.84001   -13.95876     2.94906                                  
INPUT CARD>C     6.0    18.26494   -14.87453     1.96580                                  
INPUT CARD>H     1.0    15.20451   -15.81495     0.70980                                  
INPUT CARD>H     1.0    18.55507   -13.44684     3.58554                                  
INPUT CARD>C     6.0    14.40604   -13.15566     3.64773                                  
INPUT CARD>H     1.0    19.54608   -17.21333     2.42898                                  
INPUT CARD>H     1.0    13.61484   -12.64609     4.18134                                  
INPUT CARD>N     7.0    23.79151   -15.74801     1.26870                                  
INPUT CARD>N     7.0    23.00829   -13.74210     0.77243                                  
INPUT CARD>H     1.0    26.42311   -15.60980     1.70113                                  
INPUT CARD>H     1.0    24.88604   -12.51762    -0.88976                                  
INPUT CARD>N     7.0    14.24303   -14.01271     2.66629                                  
INPUT CARD>N     7.0    15.72758   -12.96670     3.93915                                  
INPUT CARD>H     1.0    29.11431   -13.01241    -0.40662                                  
INPUT CARD>H     1.0    23.00110   -12.77274     0.49753                                  
INPUT CARD>H     1.0    16.09549   -12.35886     4.65611                                  
INPUT CARD> $END                                                                          
  64000000 WORDS OF MEMORY AVAILABLE

   BASIS OPTIONS
    -------------
   GBASIS=N31          IGAUSS=       6      POLAR=POPN31  
    NDFUNC=       2     NFFUNC=       0     DIFFSP=       T
    NPFUNC=       1      DIFFS=       F     BASNAM=        
    SPLIT2=     2.00000000     0.50000000


    RUN TITLE
    ---------
PBI_success_test                                                                

THE POINT GROUP OF THE MOLECULE IS C1      
THE ORDER OF THE PRINCIPAL AXIS IS     0

ATOM      ATOMIC                      COORDINATES (BOHR)
          CHARGE         X                   Y                   Z
H           1.0    33.3219918757      -30.6817801093        0.7653768195
C           6.0    38.1962754994      -31.0463460468        3.9175531506
C           6.0    40.7727846029      -31.6069710556        3.6448089988
C           6.0    42.3995552194      -29.7010501161        2.7969078454
C           6.0    41.4218298906      -27.3329777891        2.2452212405
C           6.0    38.8659754922      -26.7177963911        2.5159244883
C           6.0    37.2250130335      -28.6315030016        3.3747671552
H           1.0    41.5058849025      -33.4696739617        4.0807309897
H           1.0    38.1656619384      -24.8437551291        2.0628626827
C           6.0    45.5881843648      -27.4927730187        1.5590428371
C           6.0    51.0491334214      -23.9049392584       -1.3711095877
C           6.0    48.5820583499      -24.6457307428       -0.7787560795
C           6.0    48.1421490372      -26.6565503718        0.8910058032
C           6.0    50.2292380071      -27.9169598111        1.9309031170
C           6.0    52.6930060581      -27.1718219569        1.3465809443
C           6.0    53.1011490769      -25.1630621292       -0.3032254320
H           1.0    51.3702167639      -22.3551371813       -2.6809731560
H           1.0    54.2858182986      -28.1691626415        2.1754147625
C           6.0    32.7093805050      -29.3509027879        2.2106581522
C           6.0    30.1100246144      -28.9189303243        2.5094616254
C           6.0    29.3137507750      -27.2105802369        4.3668355042
C           6.0    31.1129399906      -25.9918770502        5.8424280417
C           6.0    33.7127305182      -26.3782315284        5.5729153214
C           6.0    34.5157317822      -28.1087858961        3.7148233467
H           1.0    28.7323576776      -29.8859220095        1.3413275061
H           1.0    35.0639979830      -25.4108430007        6.7756881180
C           6.0    27.2234681682      -24.8605925876        6.8932101772
H           1.0    36.9367353341      -32.5284770362        4.5901066297
H           1.0    25.7283169667      -23.8976449161        7.9015868615
N           7.0    44.9594347341      -29.7594237519        2.3974953606
N           7.0    43.4793635460      -25.9688034959        1.4596810447
H           1.0    49.9324376434      -29.4982447231        3.2146695695
H           1.0    47.0277965195      -23.6548718184       -1.6814025948
N           7.0    26.9154239349      -26.4801822454        5.0385575038
N           7.0    29.7208166500      -24.5035099650        7.4439141245
H           1.0    55.0180682216      -24.5898893399       -0.7684003811
H           1.0    43.4657764162      -24.1369787124        0.9401953707
H           1.0    30.4160657381      -23.3548589206        8.7987720687

        INTERNUCLEAR DISTANCES (ANGS.)
         ------------------------------

...
...               I skip to the last optimization step
...
...

37 H       6.1435712    0.0000000    7.9130163  
 38 H      13.8496860    7.9130163    0.0000000  

* ... LESS THAN  3.000

...... END OF ONE-ELECTRON INTEGRALS ......
CPU     0: STEP CPU TIME=     0.60 TOTAL CPU TIME=   119891.9 ( 1998.2 MIN)
TOTAL WALL CLOCK TIME=   120823.3 SECONDS, CPU UTILIZATION IS  99.23SCP> ...WARNING (SYMORB.SRC)...
THE INPUT BASIS SET CONTAINS APPROXIMATE LINEAR DEPENDENCE.
THE SMALLEST EIGENVALUE OF THE OVERLAP MATRIX IS   8.774659E-08
THERE ARE    4 EIGENVALUES LESS THAN QMTTOL=  1.00E-06
EIGENVECTORS BELOW -QMTTOL- ARE DROPPED FROM THE MO SPACE,
IN ORDER TO ELIMINATE THE APPROXIMATE LINEAR DEPENDENCE.
 ...... END OF TWO-ELECTRON INTEGRALS .....
CPU     0: STEP CPU TIME=     1.20 TOTAL CPU TIME=   119893.1 ( 1998.2 MIN)
TOTAL WALL CLOCK TIME=   120824.6 SECONDS, CPU UTILIZATION IS  99.23SCP>          ---------------------------
           RO-B3LYP SCF CALCULATION
         ---------------------------
       DENSITY MATRIX CONVERGENCE THRESHOLD=  2.00E-05
    COARSE -> FINE DFT GRID SWITCH THRESHOLD=  3.00E-04 (SWITCH IN $DFT)
                  HF -> DFT SWITCH THRESHOLD=  5.00E-03 (SWOFF IN $DFT)

DIRECT SCF CALCULATION, SCHWRZ=T   FDIFF=F

DFT CODE IS SWITCHING FROM THE FINE GRID NRAD= 96,  NLEB=  302
                     TO THE COARSE GRID NRAD0= 24, NLEB0=  110

                                                                              NONZERO     BLOCKS
ITER EX      TOTAL ENERGY        E CHANGE  DENSITY CHANGE    DIIS ERROR      INTEGRALS    SKIPPED
         * * *   INITIATING DIIS PROCEDURE   * * *
  1  0     -989.0917601892  -989.0917601892   3.901538837   0.001326360     7033340737  109531694
  2  1     -989.0920052851    -0.0002450959   0.081160739   0.000184231     7034396579  109441961
  3  2     -989.0919991053     0.0000061798   0.012556644   0.000261877     7034420601  109440071
  4  3     -989.0920128956    -0.0000137904   0.003532393   0.000047294     7034416162  109439964
  5  4     -989.0920130955    -0.0000001998   0.000979243   0.000029102     7034416494  109439834
  6  5     -989.0920132043    -0.0000001089   0.000377189   0.000006386     7034416606  109439855
  7  6     -989.0920132096    -0.0000000053   0.000325102   0.000004649     7034416685  109439847
  8  7     -989.0920132112    -0.0000000015   0.000091959   0.000001162     7034416613  109439858
DFT CODE IS SWITCHING BACK TO THE FINE GRID
         * * *   INITIATING DIIS PROCEDURE   * * *
  9  8     -989.0807476145     0.0112655967   3.868136026   0.001144858     7034416714  109439850
 10  9     -989.0808435561    -0.0000959416   0.056728944   0.000133578     7033364918  109530432
 11 10     -989.0808413000     0.0000022561   0.006365957   0.000204538     7033348101  109531623
 12 11     -989.0808462322    -0.0000049322   0.001848841   0.000027919     7033341604  109531871
 13 12     -989.0808463185    -0.0000000863   0.000926744   0.000027901     7033343281  109531860
 14 13     -989.0808463734    -0.0000000549   0.000510660   0.000006421     7033342161  109531911
 15 14     -989.0808463784    -0.0000000051   0.000105945   0.000002009     7033342723  109531894
 16 15     -989.0808463787    -0.0000000003   0.000024005   0.000000731     7033342521  109531898
 17 16     -989.0808463788     0.0000000000   0.000024516   0.000000211     7033342522  109531898

        ----------------
        ENERGY CONVERGED
         ----------------
   TIME TO FORM FOCK OPERATORS=     879.3 SECONDS (      51.7 SEC/ITER)
    FOCK TIME ON FIRST ITERATION=      41.0, LAST ITERATION=      61.6
    TIME TO SOLVE SCF EQUATIONS=      63.9 SECONDS (       3.8 SEC/ITER)

FINAL RO-B3LYP ENERGY IS     -989.0808463788 AFTER  17 ITERATIONS
DFT EXCHANGE + CORRELATION ENERGY =      -113.8633968659
TOTAL ELECTRON NUMBER             =       162.0002476941

        --------------------
        SPIN SZ   =    0.000
         S-SQUARED =    0.000
         --------------------
...... END OF ROHF CALCULATION ......
CPU     0: STEP CPU TIME=   952.04 TOTAL CPU TIME=   120845.2 ( 2014.1 MIN)
TOTAL WALL CLOCK TIME=   121784.8 SECONDS, CPU UTILIZATION IS  99.23SCBR> ..... END OF 1-ELECTRON GRADIENT ......
CPU     0: STEP CPU TIME=     0.49 TOTAL CPU TIME=   120845.7 ( 2014.1 MIN)
TOTAL WALL CLOCK TIME=   121785.3 SECONDS, CPU UTILIZATION IS  99.23SCBR> MEMORY FOR GRID POINT CONTRIBUTIONS TO THE DFT GRADIENT=   3463031 WORDS.
CPU     0: STEP CPU TIME=   158.98 TOTAL CPU TIME=   121004.6 ( 2016.7 MIN)
TOTAL WALL CLOCK TIME=   121944.8 SECONDS, CPU UTILIZATION IS  99.23SCBR> ...... END OF 2-ELECTRON GRADIENT ......
CPU     0: STEP CPU TIME=    94.62 TOTAL CPU TIME=   121099.3 ( 2018.3 MIN)
TOTAL WALL CLOCK TIME=   122039.9 SECONDS, CPU UTILIZATION IS  99.23SCP>          NSERCH=100     ENERGY=    -989.0808464

                               -----------------------
                               GRADIENT (HARTREE/BOHR)
                                -----------------------
      ATOM     ZNUC       DE/DX         DE/DY         DE/DZ
--------------------------------------------------------------
   1  H            1.0    -0.0005249     0.0003458     0.0001860
   2  C            6.0    -0.0004915     0.0004304     0.0004995
   3  C            6.0    -0.0001174    -0.0002618    -0.0001516
   4  C            6.0     0.0006410     0.0014097    -0.0000390
   5  C            6.0    -0.0007630     0.0004524     0.0000192
   6  C            6.0    -0.0004179     0.0001451     0.0001090
   7  C            6.0     0.0001618    -0.0010304    -0.0002585
   8  H            1.0    -0.0000259     0.0003551    -0.0000339
   9  H            1.0     0.0001524    -0.0000872    -0.0001365
  10  C            6.0    -0.0005369     0.0005158     0.0001793
  11  C            6.0     0.0006082     0.0017679    -0.0006991
  12  C            6.0     0.0003219    -0.0003260     0.0003675
  13  C            6.0    -0.0008054    -0.0011972     0.0003958
  14  C            6.0     0.0001511     0.0015549    -0.0008717
  15  C            6.0     0.0012037    -0.0004722     0.0005969
  16  C            6.0    -0.0014160    -0.0011085     0.0003490
  17  H            1.0    -0.0000829    -0.0002954    -0.0002439
  18  H            1.0     0.0001119    -0.0000666     0.0000423
  19  C            6.0     0.0010956    -0.0012274    -0.0010086
  20  C            6.0     0.0004632     0.0001816     0.0002076
  21  C            6.0    -0.0010119     0.0001737    -0.0000830
  22  C            6.0     0.0008603     0.0005329    -0.0003061
  23  C            6.0    -0.0000778    -0.0006730    -0.0001271
  24  C            6.0     0.0000753     0.0015732     0.0007202
  25  H            1.0    -0.0006905    -0.0001624    -0.0002724
  26  H            1.0     0.0005277     0.0007283     0.0001689
  27  C            6.0     0.0002055    -0.0008163    -0.0004650
  28  H            1.0     0.0001135    -0.0000394     0.0000449
  29  H            1.0    -0.0003747     0.0000765     0.0005820
  30  N            7.0     0.0005428    -0.0007820    -0.0002750
  31  N            7.0     0.0001065    -0.0031424     0.0004040
  32  H            1.0    -0.0000452     0.0000659    -0.0001494
  33  H            1.0     0.0004968    -0.0004500     0.0000217
  34  N            7.0    -0.0003740     0.0002290     0.0001892
  35  N            7.0    -0.0002526    -0.0005692     0.0000690
  36  H            1.0    -0.0000906     0.0001514     0.0001904
  37  H            1.0    -0.0000614     0.0019126    -0.0002930
  38  H            1.0     0.0003212     0.0001054     0.0000711

        MAXIMUM GRADIENT = 0.0031424    RMS GRADIENT = 0.0006651

NSERCH: 100  E=     -989.0808463788  GRAD. MAX=  0.0031424  R.M.S.=  0.0006651

        HESSIAN UPDATED USING THE BFGS FORMULA
            ACTUAL ENERGY CHANGE WAS   0.0000370771
         PREDICTED ENERGY CHANGE WAS  -0.0000284713 RATIO= -1.302
         MIN SEARCH, CORRECT HESSIAN, TRYING PURE NR STEP
              NR STEP HAS LENGTH         =  36.053474
         TRIM/QA LAMBDA FOR NON-TS MODES =  -0.00429369
         TRIM/QA STEP HAS LENGTH         =   0.050000
         RADIUS OF STEP TAKEN=   0.05000  CURRENT TRUST RADIUS=   0.05000

    ***** FAILURE TO LOCATE STATIONARY POINT, TOO MANY STEPS TAKEN *****
    UPDATED HESSIAN, GEOMETRY, AND VECTORS WILL BE PUNCHED FOR RESTART
**** THE GEOMETRY SEARCH IS NOT CONVERGED! ****

THE NEXT PREDICTED SET OF COORDINATES FOLLOWS.  THEIR
ENERGY AND GRADIENT IS UNKNOWN.  YOU MAY PREFER TO RESTART
WITH SOME OTHER COORDINATES THAN THESE.

YOU SHOULD RESTART "OPTIMIZE" RUNS WITH THE COORDINATES
WHOSE ENERGY IS LOWEST.  RESTART "SADPOINT" RUNS WITH THE
COORDINATES WHOSE RMS GRADIENT IS SMALLEST.  THESE ARE NOT
ALWAYS THE LAST POINT COMPUTED!
COORDINATES OF ALL ATOMS ARE (ANGS)
  ATOM   CHARGE       X              Y              Z
------------------------------------------------------------
H           1.0  17.6245580435 -16.4873361536   0.6820544997
C           6.0  20.2042834426 -16.4458003110   1.9383123100
C           6.0  21.5466970493 -16.7643064712   1.7819903327
C           6.0  22.4251373867 -15.7466767305   1.3930359712
C           6.0  21.9201320470 -14.4439372627   1.1684547250
C           6.0  20.5766034256 -14.1138962340   1.3370474961
C           6.0  19.7042669534 -15.1352973232   1.7302011839
H           1.0  21.9133674776 -17.7690672870   1.9636515500
H           1.0  20.2037342723 -13.1125684344   1.1446876176
C           6.0  24.1178022510 -14.5547853291   0.8072812112
C           6.0  27.0230502537 -12.5508173710  -0.5563027914
C           6.0  25.7180505947 -12.9519755342  -0.2742735263
C           6.0  25.4760489520 -14.1102341626   0.4804158835
C           6.0  26.5689663821 -14.8646566487   0.9361922612
C           6.0  27.8699014006 -14.4607047152   0.6534252044
C           6.0  28.1033973464 -13.3006200933  -0.0897850980
H           1.0  27.1940492806 -11.6571245905  -1.1488527698
H           1.0  28.7063510012 -15.0498312424   1.0169402736
C           6.0  17.2838591904 -15.6974338635   1.3436352607
C           6.0  15.9223622714 -15.5232611646   1.5535011598
C           6.0  15.5133533825 -14.4926664694   2.4064418307
C           6.0  16.4862560890 -13.6554569991   3.0011271873
C           6.0  17.8543953292 -13.8158063637   2.7844772780
C           6.0  18.2583216420 -14.8638668266   1.9508001897
H           1.0  15.1902895264 -16.1657729024   1.0763142275
H           1.0  18.5914315566 -13.1875197175   3.2757393996
C           6.0  14.4293799255 -13.1197092005   3.6351555331
H           1.0  19.5097752219 -17.2142686603   2.2618056111
H           1.0  13.6485789066 -12.5850467299   4.1589257118
N           7.0  23.7884716082 -15.7779261412   1.1672935250
N           7.0  23.0238493099 -13.7085426535   0.7789523091
H           1.0  26.3742494703 -15.7604072064   1.5141350141
H           1.0  24.8899623203 -12.3737001495  -0.6731857365
N           7.0  14.2397453489 -14.1253188742   2.8227815671
N           7.0  15.7547176361 -12.7793097178   3.7852769171
H           1.0  29.1190472293 -12.9867578224  -0.3087223075
H           1.0  23.0511250149 -12.7145592311   0.6144632767
H           1.0  16.1169614601 -12.0426534120   4.3686357109

...
...
....

there are bunch of outputs after this about spin, etc which i'm not interested in for now.
Thanks you again,



[ Previous ] [ Next ] [ Index ]           Fri Feb 20 '15 0:14am
[ Reply ] [ Edit ] [ Delete ]           This message read 586 times